Le collège Anita Conti est composé, pour l’année scolaire 2020/2021, de 16 classes (+1) allant de la 6e à la 3e et une classe ULIS.
Parmi ces 17 classes, 4 sont des classes SEGPA (Section d'enseignement général et professionnel adapté) destinées aux élève en grandes difficultés scolaires
Le collège propose également des classes à dominante artistique (CHAM-CHAD) ou sportives (sections sportives) pour les élèves qui le souhaitent.

Avec 4 langues proposées (anglais, espagnol, allemand et italien, + latin dès la 5^e), unique sur le bassin de Lorient, le collège Anita Conti répond à la problématique de l’ouverture culturelle et linguistique.  L'option DNL a pour vocation de proposer un enseignement ouvert sur l’Europe par l’enseignement en langue étrangère d’une Discipline Non Linguistique et par la connaissance approfondie de la culture des pays européens

Les classes CHAM-CHAD permettent de vivre une aventure collective où musique et danse peuvent être pleinement vécues grâce à des horaires aménagés et un environnement qui offre les meilleures conditions pour une pratique artistique. Un partenariat s’appuie sur une convention entre le Collège Anita Conti, le Conservatoire à Rayonnement Départemental (CRD) et la ville de Lorient, soutenu par le Conseil Général. Ces classes s'adressent  auxélèves passionnés de musique ou de danse, de la sixième à la troisième, débutants ou non-débutants.

En 2012, une option rugby a été créée. Cette option concerne le niveau 6^e/5^e. Une convention de partenariat a été signée avec le Président du Rugby Ovalie Lorientais, qui assure un co-encadrement avec le professeur d’EPS.
En 2017, Le collège a ouvert un Centre Labellisé d’Entraînement Basket (CLE) pour les 6^e et 5^e et une section sportive basket pour les 4^e et 3^e !

Les classes SEGPA sont destinées aux élèves en grande difficulté scolaire persistante, grave et durable, collégiens à part entière  bénéficiant des mêmes droits et devoirs que les autres. Elles proposent une formation qui requiert des démarches pédagogiques adaptées, et prennent en compte les difficultés rencontrées par chaque jeune tout en se conformant aux objectifs du cycle commun des connaissances et des compétences du collège.

Les unités localisées pour l’inclusion scolaire (ULIS) permettent l’accueil dans un collège, un lycée général et technologique, ou un lycée professionnel d’un petit groupe d’élèves présentant le même type de handicap. Chaque élève scolarisé au titre des ULIS bénéficie, selon ses possibilités, de temps de scolarisation dans une classe de l’établissement scolaire où il peut effectuer des apprentissages scolaires à un rythme proche de celui des autres élèves.